设置和维护活生物石（活珊瑚礁岩）是建立一个完美海水水族箱的重要条件、。这些活的“石头”，只要给它们一些时间，这些活“石头”会给你“意外的惊喜”。无数的藻类和生物都将会重新生长，使得小型珊瑚礁石生态再度变成独立完整的生物圈，借着活珊瑚的存在，水族箱会更容易养殖海水观赏鱼和海洋生物，为什么会如此，我们仍在研究，但它确实很有作用，这才是重要的。
这些活生物石是海底取上来的珊瑚礁岩，上面存活有大量的海洋生物，放入水族箱内可以产生原来在海底时的自然生态生物。但是，这些活生物石在采集、搬运、运输过程中，遭遇日晒风吹，与空气接触之后，就使许多活生物死亡，若不经处理直接把它放入水族箱内，这些死生物的残骸便需要在箱内硝化分解，在刚建立的水族箱中硝化系统根本没有足够的硝化来硝化如此大量的污染源，这样就会使水质变坏变成白浊，甚至还有臭味产生。故使用活生物石需要经过妥善的包装运输和适当的清洗整理才行。我们在初的4～6星期中，每周定期用喷水器清洗活生物石，将清洗干净的活生物石放人才是的。或者用晒干的生物石，冲冼干净再放入水族箱。总之，采用活生物石是很重要的，但一定要注意清洗干净。