鱼缸不大，养鱼过多或者是过滤器的功率小，不能完全过滤污物，绿藻生长也会很快。
喂食过多，鱼吃不完饲料，饲料在水中腐烂，水质过度营养化，使水中更快积累氨等物质，经过硝化，会转换成硝酸盐，硝酸盐是水草和水藻的重要肥料，水中含有很多硝酸盐的话，水藻也会狂长。
过滤池的过滤能力要足够大。过滤机的过滤能力，都以升/小时来表示。要将水滤清，一般要求过滤量要达到4-7个过滤循环，具体讲，如果鱼缸的水是200升，就要配处800—1500升/小时的过滤机。
鱼只的数量和饵料的多少都要适度，鱼的蜜度过大，喂饵料过多，等于增加了污染量。
气动式过滤：在此种过滤系统中比较有名的应该算是惠宏产的水妖精，原理是利用气举使水流入过滤体(生化棉、过滤棉)中，进行生物过滤过程。过滤效果还算可以，但是一般须要配合上滤等物理过滤系统使用。多用于小型的繁殖缸、孔雀、短鲷等较少量、小型的鱼缸内。
底部式过滤器：利用底砂砂层作为大体积的滤材(渗流滤层)，通过铺设在砂层下的进水管道网，经由沉水水泵抽水，达到物理过滤及生化过滤的目地(原理类似于沉水式过滤器)因滤体较大，所以维护间格时 间较长，但维护极为不便。效果不错，缺点是安装较麻烦，还有草缸无法使用，会照成底肥的严重流失。